В ответ на эти набеги шведы предприняли Первый крестовый поход (1157) против язычников-финнов. Он увенчался завоеванием юго-западной Финляндии и распространением там христианства. Во время Второго крестового похода (1249–1250) были покорены центральные районы южной Финляндии, а во время Третьего похода (1293–1300) власть шведов распространилась на восточные районы. На завоеванных землях были сооружены крепости. Таким образом шведское государство проникло в восточную часть Балтийского региона, однако на эти же земли претендовала Россия, искавшая выход по морю в Европу.

Финляндия получила некоторые выгоды от объединения со Швецией. Принятие новой религии сопровождалось распространением европейских обычаев, нравов и культуры. Смешанные браки между финнами и шведами расширили представительство финнов в органах местного управления. Воцарение династии Ваза в Швеции привело к установлению более строгого и эффективного правления в Финляндии. С 1527 в Финляндии шла церковная Реформация. Распространение лютеранства сопровождалось активной просветительской деятельностью. К этому же времени относится становление финского литературного языка. С 1548 на финском языке стали проводиться церковные службы.
В 17 в. Швеция предприняла некоторые усовершенствования административной системы в Финляндии. Шведский генерал-губернатор Пер Браге ввел апелляционный суд и основал университет в Турку, а также предоставил права самостоятельности городам. Представители Финляндии были допущены в шведский риксдаг. Хотя эти реформы в первую очередь затронули интересы шведской знати, жившей в Финляндии, местные крестьяне тоже извлекали от них некоторую выгоду.

В стране сравнительно рано началось развитие ремесел и товарно-денежных отношений. Крестьяне наряду с сельским хозяйством занимались кузнечным делом, ткачеством, смолокурением, распиловкой леса. Началась добыча полезных ископаемых, помещики основывали небольшие металлургические заводы, работавшие на древесном угле. Часть продукции помещичьих и государственных предприятий и изделий крестьянского и цехового ремесла (смола, бумага) шла на экспорт. Взамен импортировались хлеб, соль и некоторые другие товары.

Во время Великой Северной войны (1700–1721) Финляндия превратилась в арену боевых действий между Швецией и Россией за господство на Балтике. Война сопровождалась голодом и эпидемиями, от которых погибла почти половина населения страны. В 1721 на территории Финляндии осталось всего 250 тыс. человек. После победы в Северной войне Россия при Петре I вернула по Ништадтскому мирному договору (1721) юго-запад Карелии с побережьем Финского залива.

Стремясь захватить у России земли, завоеванные Петром I, Швеция объявила ей в 1741 войну, но уже через год вся Финляндия оказалась в руках русских. По Абоскому мирному договору 1743 к России отошла территория до р.Кюмийоки с укрепленными городами Вильманстранд (ныне Лаппенранта) и Фридрихсгамн (Хамина).